Cengiz Bektaş, mimarlık alanında önemli bir isim olmasının yanı sıra, Afrodisias Müzesi'nde gerçekleştirdiği projelerle de dikkat çekmektedir. Ek Müze Projesi ve Yenileme Projesi gibi çalışmaları, müzenin kültürel zenginliğini ve tarihsel değerini koruma amacını taşımaktadır. Bu projeler, hem mimari estetik hem de arkeolojik mirasın sunumu açısından büyük öneme sahiptir. Ayrıca, Bektaş'ın Afrodisias üzerine yazdığı eser, bu antik kentin tarihine dair derinlemesine bir bakış sunmaktadır.

Cengiz Bektaş, Afrodisias Müzesi ile ilgili şu çalışmalara imza atmıştır:

• Ek Müze Projesi. 2007 yılında tamamlanan ve Sebasteion eserlerinin sergilendiği ek müzenin tasarımı Cengiz Bektaş'a aittir.
• Yenileme Projesi. 2001 yılında başlatılan ve 2009 yılında tamamlanan yenileme projesinin başında Yüksek Mimar Cengiz Bektaş yer almıştır.

Ayrıca, Cengiz Bektaş'ın "Afrodisias" adlı bir kitabı bulunmaktadır. Afrodisias Müzesi ile ilgili bazı diğer bilgiler:

• Konumu. Aydın'ın Karacasu İlçesi Geyre Beldesi sınırları içinde yer alır.
• Tarihçesi. 1971-1972 kışında inşasına başlanan müze, 1977 sonbaharında tamamlanmıştır.
• Sergilenen Eserler. Müzede, Akropol Tepe ve Pekmez Tepe höyüklerinde yapılan kazılardan çıkan prehistorik eserler, Lidya seramikleri, Arkaik, Klasik, Helenistik dönem eserleri ile Roma, Bizans ve Erken İslami devir eserleri sergilenmektedir.