Amerikan Tabiat Tarihi Müzesi, 19. yüzyılın sonlarına doğru doğa bilimlerine olan ilginin artmasıyla birlikte kuruldu. Bu dönemde, çeşitli bilim insanlarının ve doğa severlerin katkılarıyla, doğanın zenginliklerini keşfetmek ve korumak amacıyla bir araya gelindi. Müze, zamanla sadece sergileme alanı değil, aynı zamanda bilimsel araştırmaların da merkezi haline geldi.

Amerikan Doğa Tarihi Müzesi, 1869 yılında Theodore Roosevelt Sr. ve bilim insanı Albert S. Bickmore'un girişimleriyle kurulmuştur. Müzenin amacı, doğa bilimleri hakkında bilgi toplamak, korumak ve bu bilgiyi halka sunmak olarak belirlenmiştir. Müzenin inşası, yapıldığı dönemden bu yana devam etmiş ve zamanla yeni binaların eklenmesiyle genişlemiştir. Günümüzde müze, 26 bağlı binadan ve 45 sergi salonundan oluşmaktadır.