Aokigahara Ormanı, volkanik kökenli bir yapıya sahip olup, zengin bir ekosistemi barındırmaktadır. Bu orman, Japonya'nın Fuji Dağı'nın eteklerinde yer alır ve geniş lav akıntıları üzerinde gelişmiştir. Aokigahara'nın jeolojik yapısı, hem zemin sertliği hem de mikro topografik özellikleri ile dikkat çekerken, bu durum bölgedeki bitki örtüsünün çeşitliliğine ve ormanın genel atmosferine de etki etmektedir.

Aokigahara Ormanı, jeolojik bakımdan genç volkanik bir sahada, bazaltik lav akıntıları üzerinde gelişmiş bir orman örtüsüne sahiptir. Ormanın bazı özellikleri:

• Zemin: Kürek gibi el aletleriyle delinemeyecek kadar sert volkanik kayalardan oluşur.
• Mikro topografya: Yer yer lav tüpleri, çöküntüler ve boşluklar bulunur.
• Bitki örtüsü: İğne yapraklı ağaçlardan oluşur; baldıran köknar ve Japon selvi yaygındır.
• İklimsel özellikler: Düşük ışık ve serin, nemli bir mikro iklim görülür.

Bu özellikler, ormanın yoğun ve sık bir bitki örtüsüne sahip olmasına, yürüyüş patikalarının dışına çıkıldığında yön bulmayı zorlaştırmasına ve görsel ile işitsel olarak "soğurucu" bir bitki dokusu hissi yaratmasına yol açar.