1319 yılında meydana gelen deprem, Ani Kalesi'nin yapısal bütünlüğünü derinden etkilemiştir. Bu doğal felaket, bölgedeki tarihi eserlerin yanı sıra kentin sosyal ve ekonomik yapısını da sarsmıştır. Depremin ardından, Ani Kalesi'nin tarihi önemi azalmış, birçok yapı hasar görmüş ve bölge, tarihsel sürecinde önemli bir değişim yaşamıştır.

1319 depremi, Ani Kalesi'nde ciddi hasarlara yol açmıştır. Ani Katedrali (Meryem Ana Kilisesi), 1319 depreminde kubbesini kaybetmiş ve kullanılamayacak hale gelmiştir. Genel olarak Ani kenti, 1319 depremi nedeniyle büyük hasar almış ve bu durum, şehrin önemini yitirmesine yol açmıştır. Daha sonraki dönemlerde, 1832 ve 1988 depremlerinde de Ani'deki yapılarda hasarlar meydana gelmiştir. Ani, 1319 depreminden sonra Timur tarafından ele geçirilmiş ve bu dönemde de tahrip edilmiştir.