Pamukkale, yalnızca travertenleriyle değil, aynı zamanda çevresindeki doğal güzellikleriyle de dikkat çeken bir yerdir. Bu benzersiz alan, tarihi kalıntılarla dolu antik kentler ve büyüleyici doğal yapılarla çevrilidir. Özellikle Kleopatra Antik Havuzu ve Hierapolis Antik Kenti, ziyaretçilerin ilgisini çeken önemli noktalar arasında yer alırken, Kaklık Mağarası da doğa tutkunları için keşfedilmeyi bekleyen bir diğer gizemli mekandır. Bu doğal oluşumlar, Pamukkale'nin sunduğu zengin kültürel ve doğal mirası gözler önüne seriyor.

Pamukkale Travertenleri'ndeki diğer doğal oluşumlar şunlardır:

• Kleopatra Antik Havuzu (Antik Havuz). Roma dönemine tarihlenen bu havuz, mineraller açısından zengin suyuyla bilinir.
• Hierapolis Antik Kenti. Travertenlerin üst kısmında yer alan bu antik kentte antik kilise, amfitiyatro ve çeşitli kalıntılar bulunur.
• Traverten terasları. Sıcak mineralli suyun kalsiyum karbonat içermesi nedeniyle oluşan beyaz teraslardır.
• Kaklık Mağarası. "Küçük Pamukkale" veya "Mağara Pamukkale" olarak da anılan bu mağarada damlataş, dikitler ve sarkıtlar bulunur.

Ayrıca, bölgede farklı bitki türleri ve kuş çeşitleri de bulunmaktadır.