Doğal Tarih Salonu, ziyaretçilerine doğanın zenginliklerini keşfetme fırsatı sunan etkileyici bir sergi alanıdır. Burada, hem geçmişe hem de günümüze dair birçok ilginç eser sergilenmektedir. Farklı coğrafyalardan ve dönemlerden gelen nadir hayvan türleri, tarihsel koleksiyonlar ve ilginç doğal oluşumlar, bu salonda keşfedilmeyi bekliyor. Her bir parça, doğanın karmaşık yapısını ve insanların bu yapıyla olan etkileşimini gözler önüne seriyor.

İstanbul Doğa Tarihi Müzesi'nde yer alan bazı eserler şunlardır:

• Nadir ve eşsiz türler: Yeni Zelanda'ya özgü "yaşayan fosil" olarak bilinen tuatara ve bir zamanlar Türkiye'ye özgü olup artık nesli tükenmiş olan Anadolu leoparı.
• Egzotik hayvan sergileri: Alaska geyiği, Okyanusya'dan bir kanguru, tapir iskeleti ve dev fil kafatasları.
• Osmanlı dönemi kuş koleksiyonu: Antika ahşap dolaplarda sergilenen rengarenk papağanlar ve yırtıcı kuşlar.
• Diğer ilginç sergiler: Cumhurbaşkanı Celal Bayar'a hediye edilen bir aslan yavrusu, 2,7 metrelik kanat açıklığına sahip bir akbaba ve altı bacaklı bir kuzu.